생물학 밀레니엄 문제 7개 공개, 생명 기원부터 사지 재생까지
- 생물학 밀레니엄 문제 7개가 millenniumproblems.bio에 올라왔음: 생명 기원, 쥐 냉동 보존, 역번역 효소, Rubisco 개선, 4중 코돈 세포, 성체 쥐 사지 재생, 박테리아 유전자 치료제 생산
- 문제마다 정량 합격 기준이 붙음. 생명 기원은 자가복제 세포가 10^6배(약 20세대) 증식하고 유전 정보 저장 방식을 보여야 하며, 냉동 보존은 성체 야생형 쥐를 24시간 이상 동결 또는 유리화한 뒤 99% 초과 생존율로 회복해야 함
- 역번역 효소 문제는 50개 아미노산 이상 펩타이드 100개를 미리 등록해 풀링한 뒤 사전 참조 없이 역번역과 시퀀싱으로 90% 이상 서열 정확도, 평균 판독 길이 25 잔기 이상, Q10 이상 품질 점수를 요구함
- Rubisco 문제는 Galdieria partita Rubisco의 CO2/O2 특이성과 옥수수 Rubisco의 kcat을 동시에 넘는 효소를 요구하고, 두 자연 효소를 각각 대조군으로 쓴 짝지은 효소 분석으로 측정함
- 만든 곳은 Edison Scientific과 FutureHouse로 페이지에 Sam Rodriques와 Michaela Hinks 이름이 있고, 4중 코돈 세포 문제는 Erika Alden DeBenedictis가 기여했음. 상금이나 결과 검증 주체는 명시되지 않음
Hacker News opinions
박테리아로 연료 만들거나 플라스틱 분해하는 것도 넣어야 하는 거 아님? 근데 플라스틱 분해 박테리아는 자연에도 있고 합성으로도 있는데, 그건 우리 학교 학생 프로젝트로도 하는 수준이라 밀레니엄 문제는 아니지.
이거 누가 만든 거임? 결과는 누가 검증하고 상금은 있음? 페이지엔 Edison Scientific이랑 FutureHouse의 Sam Rodriques, Michaela Hinks 이름만 있더라.
냉동 보존은 50년대에 햄스터 같은 소형 설치류는 이미 성공했던 걸로 아는데. 위키백과 Cryopreservation 항목 찾아보면 나옴.
수학 밀레니엄 문제는 2000년에 만들어졌고 문제당 $100만 상금이 걸려 있는데, 이건 그냥 어떤 사람이 비슷하게 어려운 문제 목록 만들어본 것뿐임. 이름은 안 맞음.
전부 공학 문제라는 게 좀 이상함. 의식의 기질이나 단백질 및 RNA 폴딩의 실제 해법, 진화의 요건 같은 건 어디 갔음?
실험과학은 다 공학적인 면이 있음. 첫 문제인 생명 기원도 제안한 메커니즘이 실제로 작동하는지 실험으로 보이라는 거잖아.
저명한 생물학자가 아닌 사람들의 애완 프로젝트 모음임. 생명 기원 같은 문제는 VC 웹페이지 하나로 누가 도전하겠냐가 바뀌진 않음. 상용화된다면 FutureHouse가 아니라 큰 자본이 가져갈 거고.
좋은 생물학 근본 문제 목록을 만드는 게 훨씬 어려움. 실험실에서 검증 가능한 것으로 제한하니까 흥미로운 부분 대부분이 빠짐. 페트리 접시와 쥐와 사람은 다르고, 그게 생물학을 어렵게 만드는 이유임.
DNA는 다 쓰긴 하지만, 아무도 실험실에서 유전 시스템이 어떻게 자가 재생산하고 생체분자를 조립하는지 보여준 적이 없음. RNA나 아미노산이 생긴다는 걸 보여도 유전 시스템에 대해선 아무 말도 못 함.
Rubisco 개선이 가능한지 모르겠음. 자연이 수십억 년 동안 할 만큼 했는데, 속도나 특이성 중 하나를 잃게 되어 있고 둘 다는 불가능하다고 봄.
자연에 더 효율적인 변이가 없다는 건 국소 최솟값이 아주 깊다는 뜻일 뿐임. 2045년쯤이면 AGI가 자기 취미로 이걸 파헤칠지도 모름. 자연보다 우월하다는 걸 증명하려고 말이지.
AlphaFold가 단백질 폴딩을 거의 해결했다는 보도와 달리, 동료들 말로는 폴딩 관련 문제도 얼마든지 목록에 넣을 만함.
사지 재생은 Michael Levin의 생체전기 연구가 문턱에 와 있다는 게 내 인상임. 잘 아는 사람 정정해줘. 성장 인자와 단백질로 재생을 유도한 연구도 최근에 읽었음.
형태 형성이 빠졌다는 말도 있는데, 그건 6번 사지 재생이 이미 다루는 거 아님? 어쨌든 이런 문제들은 GPT 토큰 태워서 풀 수 있는 게 아니라는 점은 좋음.
LLM 하나 붙여놓고 끝내면 되는 거 아님? 이름 있는 연구자 로그부터 긁어모으고.
AI 정렬 밀레니엄 문제도 누가 좀 만들어줘. 프런티어 랩들이 실제로 풀려고 하게. 인류를 멸망시킨다고 믿는다면 동기가 될 텐데.